UMR TBIP CIIL

Het onderzoek van het TBIP-team richt zich op :

• de studie van zoönosen en hun rol bij de overdracht, instandhouding en opkomst van infectieziekten (beoordeling van gezondheidsrisico's, identificatie van dierlijke reservoirs of gastheren van pathogene micro-organismen)
• de studie van gastheer-parasiet interacties en virulentiefactoren en mechanismen van bescherming of verergering tijdens infectie (gevolgen voor het verloop van infectie, studie van immuunreacties, invloed van co-infecties, biomarkeronderzoek, enz.)
• bijdragen aan de behoeften van de regio op het gebied van diagnose-instrumenten (ontwikkelen van diagnose-instrumenten die zijn aangepast aan de lokale specifieke kenmerken)

AIRFUNGUI
(Schimmels in de lucht in Frans Guyana: biodiversiteit, seizoensgebonden dynamiek en invloed van meteorologische factoren).
Het doel van dit project is om de schimmelbiodiversiteit in de lucht in Frans Guyana te bestuderen om epidemiologische surveillance van risicofactoren voor luchtwegaandoeningen en vervuilingsepisodes op te zetten. Het onderzoek zal gebruik maken van innovatieve technologieën zoals environmental DNA metabarcoding en kunstmatige intelligentie.

DEVOD
(Ontwikkeling van diagnostische hulpmiddelen).
Het doel van dit project is het opzetten van diagnostische instrumenten gebaseerd op multiplex real-time PCR, de Rapid Diagnostic Test (RDT) en biosensoren. Deze instrumenten, die zijn afgestemd op de specifieke kenmerken van de regio, zijn bedoeld voor gebruik door gezondheidszorginstellingen, zodat zij lokaal diagnostische tests kunnen uitvoeren.

ICM_C
(Onderzoek naar de besmettingsmechanismen van veneuze katheters in ziekenhuizen).
Het doel van dit project is om de bacteriële huidmicrobiota van intensive care patiënten te bestuderen met behulp van regelmatige huidmonsters die geanalyseerd worden met behulp van microbiologie en metagenomica. De hypothese is dat intensieve zorg deze microbiota destabiliseert (wat leidt tot dysbiose), wat leidt tot het verschijnen van pathogene bacteriën en nosocomiale infecties.

Gekraagde pekari's
Pekari's, een integraal onderdeel van de fauna van Frans Guyana en Amazonië, zijn een voedselbron die diep geworteld is in de cultuur van de lokale bevolking. Om het behoud van de wilde fauna te verzoenen met respect voor de lokale gebruiken, wordt de ontwikkeling van een kweekindustrie steeds noodzakelijker. Om de gezondheidsveiligheid van kwekerijen en consumenten te garanderen, is het noodzakelijk om over de nodige controle-instrumenten te beschikken. Het doel van dit project is (1) het karakteriseren van de humaan pathogene micro-organismen die aanwezig zijn in de ringnek pekari, (2) het evalueren van het risico op overdracht op mensen en (3) het benadrukken van de aanwezigheid van pathogenen die een impact kunnen hebben op de ontwikkeling van gekweekte dieren.

LabVet
Het is bekend dat antropisering en de vernietiging van de biodiversiteit de overdracht van ziekteverwekkers van wilde dieren naar huisdieren en landbouwhuisdieren bevorderen, wat het ontstaan van nieuwe epidemieën in de hand kan werken. Het LabVet project heeft als doel het verzamelen, vergelijken en identificeren van ziekteverwekkers die aanwezig zijn in monsters van huisdieren, landbouwhuisdieren en wilde dieren. Het doel van de studie is om een inventaris op te maken van de parasitaire, bacteriële en schimmelpathogenen die in Frankrijk circuleren. De resultaten zullen een eerste schatting geven van de zoönosen die in de regio aanwezig zijn, zodat onderzoeksprojecten gericht op zoönosen bij dieren, zoals leptospirose en de ziekte van Chagas, gericht en geprioriteerd kunnen worden.

Identificatie van micro-organismen (water, lucht, bodem, dieren, enz.)

• Moleculaire biologie :
  • dPCR, qPCR, conventionele PCR
  • sequentiebepaling (DNA en metagenomics, enz.)
• Microscopie
• Serologie (detectie van antigenen, antilichamen)
• Celculturen

voor de detectie en identificatie van micro-organismen uit verschillende matrices (water, lucht, bodem, dieren, enz.). Het TBIP-team werkt samen met andere onderzoeksteams en kan ook diensten aanbieden aan professionals.

Training en overdracht van vaardigheden
Het TBIP-laboratorium biedt personeelstraining in moleculaire biologie, serologie en diagnosetechnieken op celcultuur. Trainingen gericht op het overbrengen van vaardigheden in moleculaire biologie worden regelmatig gegeven aan het technisch personeel van het universitair laboratorium voor parasitologie-mycologie in het Cayenne Hospital Centre.

Analyse van de microbiologische kwaliteit van de lucht in ruimten voor professioneel gebruik
Het TBIP-laboratorium levert analyses van de luchtkwaliteit aan professionele organisaties. Teamleden bezoeken de te testen ruimten, nemen luchtmonsters en testen op allergenen zoals schimmels.

Partners Atmo Guyane en Universitair Ziekenhuis Laboratorium voor Parasitologie en Mycologie - Cayenne Ziekenhuiscentrum 

Gevoeligheidsbeproeving van anti-leishmania plantenextracten
Het TBIP-laboratorium biedt zijn expertise aan in het beoordelen van de antiLeishmania van verschillende stoffen. De te testen extracten worden naar het TBIP-laboratorium gestuurd, dat de gevoeligheid van deze extracten beoordeelt voor de promastigote vorm van de parasiet en, recenter, voor de amastigote vorm in macrofagen.

Samenwerking: Cutanex (sinds 2019), Ecofog (2017-22)

Adria MATOUTEZe is promovendus en assistent-ingenieur in het laboratorium UMR-CIIL-TBIP. Het werk dat ze tijdens haar proefschrift uitvoert, maakt deel uit van het Airfungui-project, dat tot doel heeft de schimmeldiversiteit in de lucht te bestuderen. Het onderzoek is ook gericht op het identificeren van correlaties tussen biotische factoren (schimmels, bacteriën, enz.) en abiotische factoren (temperatuur, windsterkte, enz.) om een voorspellend model te ontwikkelen voor het monitoren van allergene en pathogene micro-organismen. Haar onderzoek richt zich ook op de micro-biodiversiteit van wilde dieren in Frans Guyana. Ze is verantwoordelijk voor het inzetten van bio-informatica tools binnen de eenheid.

Ghislaine PREVOT, Universitair hoogleraar Biochemie en Microbiologie sinds 2017 en vicevoorzitter Onderzoek en Ontwikkeling aan de Universiteit van Guyana sinds 2023. Ze schreef haar doctoraalscriptie over de studie van de vectoriële competentie van Anopheles in relatie tot Plasmodium falciparumZe werkt momenteel aan de studie van de bacterie die verantwoordelijk is voor malaria, onder begeleiding van Catherine BOURGOUIN aan het Institut Pasteur in Parijs en aan de Pierre et Marie Curie Universiteit (Sorbonne Université). Haar onderzoek richt zich met name op leishmaniasis (immuunrespons, Leishmania RNA-virus, geneesmiddelenresistentie, vectoren) en meer in het algemeen op door vectoren overgedragen ziekten en zoönosen. Sinds 2002 is ze docent-onderzoeker aan de Universiteit van Frans-Guyana en is ze betrokken bij het opleiden van studenten en studenten geneeskunde. Ze draagt haar expertise bij aan verschillende organen, waaronder het Regionale Observatorium voor Gezondheid (2019 tot nu toe), de Economische, Sociale, Milieu-, Culturele en Onderwijsraad van Frans Guyana (sinds 2024), de Regionale Wetenschappelijke Raad voor Natuurlijk Erfgoed (2007 tot 2024) en de Wetenschappelijke Raad van het Frans-Braziliaanse Centrum voor Biodiversiteit in het Amazonegebied (sinds 2024).

Magalie DEMAR, Universitair Professor - Ziekenhuisarts (PU-PH) in Parasitologie en Mycologie sinds 2015 aan de Universiteit van Guyana, leidde ze van 2017 tot 2019 het onderzoeksteam "Amazonian Ecosystems and Tropical Pathology" (EPaT), dat het TBIP-team werd van de UMR CIIL, dat ze sinds 2020 mede leidt. Ze voltooide haar proefschrift over de epidemiologie van toxoplasmose onder supervisie van Prof. CARME aan het CHU des Antilles-Guyane. Haar onderzoekswerk richt zich op zoönosen (wilde, gekweekte en gedomesticeerde fauna), in het bijzonder toxoplasmose in het Amazonegebied en intestinale parasieten. Ze is ook betrokken bij het lesgeven en opleiden voor Masters-cursussen, voornamelijk in parasitologie en mycologie. 

Marine GINOUVESZe promoveerde in 2020 in de cellulaire en moleculaire biologie en is sinds 2009 onderzoeksingenieur in het TBIP-laboratorium. Ze schreef haar proefschrift over de fylogenie van Leishmania RNA-virus (LRV) en hun betrokkenheid bij cutane leishmaniasis, onder supervisie van Prof. COUPPIE en Prof. PREVOT, aan de Universiteit van Guyana (UG). Zijn onderzoekswerk richt zich op leishmaniasis (LRV, vectoren, gevoeligheidstests, enz.) in vitro), zoönosen (wilde, gekweekte en gedomesticeerde dieren) en de ontwikkeling van diagnostische instrumenten aangepast aan de behoeften van de regio voor de detectie van parasieten, bacteriën en schimmels. Ze is ook betrokken bij het universitaire leven, als lid van UG-raden en bij onderwijs- en trainingsactiviteiten voor bachelor- en masterstudenten. Ze is ook betrokken bij het budgetbeheer van het TBIP-team (afdeling Cayenne).

Mona SAOUTSinds 2018 is ze biologietechnicus in het TBIP-laboratorium. Ze is betrokken bij verschillende onderzoeksprojecten bij TBIP met betrekking tot zoönosen in Frans Guyana, waarbij ze samenwerkt met dierenartsen op het gebied van leptospirose, de ziekte van Chagas en equine piroplasmose. Ze voert serologische en moleculair biologische analyses uit om de aanwezigheid van ziekteverwekkers te identificeren in biologische monsters van dieren. Als preventieassistent voor alle laboratoria Biologie en Scheikunde van de Universiteit van Guyana is ze betrokken bij veiligheidskwesties op de werkplek.